其缺點為：1)陰、陽塑料螺桿之間必須存在的間隙，造成氣密性不甚理想，是無油螺桿式空壓機的能源效率不佳的主要原因，甚至可說是相同容積的各類型空壓中最差的；噴油螺桿式空壓機解決了這一問題，但其油濾芯造成的壓力損失又增加了一定比例能源的消耗。2)無油螺桿式壓縮機本體僅有3～5年的壽命，換修空壓機本體的技術又往往被原制造廠保留，因此，更換整組空壓機本體的成本一般都會超過購置新機的六成，這也是使用者對此類型空壓機最大的詬病。3)噴油螺桿式空壓機在長期運轉后長期停機，空壓機內的轉子卡住現象(主要因為潤滑油中雜質沉淀結油垢)屢見不鮮，備用空壓機變成極不可靠的備用狀態。4)噴油螺桿式空壓機壓縮空氣中含有油分，不適合食品工業使用。5)噴油螺桿式空壓機對潤滑油品質要求較高，需定期進行潤滑油更換和濾芯更換等保養，維護費用較高。